Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klhl40Q9D783 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klhl40Q9D783 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Klhl40Q9D783 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klhl40Q9D783 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Klhl40Q9D783 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klhl40Q9D783 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Klhl40Q9D783 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klhl40Q9D783 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klhl40Q9D783 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klhl40Q9D783 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhl40Q9D783 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhl40Q9D783 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klhl40Q9D783 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klhl40Q9D783 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl40Q9D783 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl40Q9D783 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Klhl40Q9D783 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Klhl40Q9D783 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Klhl40Q9D783 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klhl40Q9D783 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Klhl40Q9D783 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhl40Q9D783 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhl40Q9D783 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms