Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrirQ9D735 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TrirQ9D735 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrirQ9D735 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrirQ9D735 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrirQ9D735 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrirQ9D735 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrirQ9D735 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrirQ9D735 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrirQ9D735 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrirQ9D735 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrirQ9D735 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrirQ9D735 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrirQ9D735 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrirQ9D735 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrirQ9D735 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrirQ9D735 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrirQ9D735 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrirQ9D735 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrirQ9D735 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrirQ9D735 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrirQ9D735 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrirQ9D735 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrirQ9D735 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrirQ9D735 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms