Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nop56Q9D6Z1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop56Q9D6Z1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop56Q9D6Z1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop56Q9D6Z1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop56Q9D6Z1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop56Q9D6Z1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop56Q9D6Z1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop56Q9D6Z1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nop56Q9D6Z1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nop56Q9D6Z1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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