Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fundc2Q9D6K8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fundc2Q9D6K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fundc2Q9D6K8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fundc2Q9D6K8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fundc2Q9D6K8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fundc2Q9D6K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fundc2Q9D6K8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc2Q9D6K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fundc2Q9D6K8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc2Q9D6K8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fundc2Q9D6K8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc2Q9D6K8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc2Q9D6K8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fundc2Q9D6K8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fundc2Q9D6K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fundc2Q9D6K8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc2Q9D6K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fundc2Q9D6K8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fundc2Q9D6K8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fundc2Q9D6K8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fundc2Q9D6K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms