Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hrct1Q9D6B9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hrct1Q9D6B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hrct1Q9D6B9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hrct1Q9D6B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hrct1Q9D6B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hrct1Q9D6B9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hrct1Q9D6B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hrct1Q9D6B9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms