Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gins2Q9D600 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gins2Q9D600 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gins2Q9D600 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gins2Q9D600 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gins2Q9D600 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gins2Q9D600 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gins2Q9D600 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gins2Q9D600 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gins2Q9D600 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gins2Q9D600 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gins2Q9D600 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gins2Q9D600 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gins2Q9D600 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gins2Q9D600 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gins2Q9D600 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gins2Q9D600 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gins2Q9D600 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gins2Q9D600 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gins2Q9D600 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gins2Q9D600 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gins2Q9D600 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gins2Q9D600 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gins2Q9D600 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gins2Q9D600 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gins2Q9D600 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gins2Q9D600 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gins2Q9D600 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gins2Q9D600 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gins2Q9D600 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gins2Q9D600 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gins2Q9D600 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gins2Q9D600 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gins2Q9D600 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gins2Q9D600 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gins2Q9D600 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gins2Q9D600 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gins2Q9D600 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gins2Q9D600 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gins2Q9D600 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gins2Q9D600 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gins2Q9D600 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gins2Q9D600 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gins2Q9D600 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gins2Q9D600 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms