Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V1

Actl11, Actin-like 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl11Q9D5V1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actl11Q9D5V1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actl11Q9D5V1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actl11Q9D5V1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actl11Q9D5V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actl11Q9D5V1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actl11Q9D5V1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actl11Q9D5V1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actl11Q9D5V1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl11Q9D5V1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Actl11Q9D5V1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Actl11Q9D5V1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actl11Q9D5V1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actl11Q9D5V1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms