Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930449I24RikQ9D5E3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930449I24RikQ9D5E3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930449I24RikQ9D5E3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930449I24RikQ9D5E3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930449I24RikQ9D5E3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930449I24RikQ9D5E3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930449I24RikQ9D5E3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930449I24RikQ9D5E3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4930449I24RikQ9D5E3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930449I24RikQ9D5E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930449I24RikQ9D5E3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930449I24RikQ9D5E3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930449I24RikQ9D5E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms