Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D4W2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D4W2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D4W2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D4W2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D4W2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D4W2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D4W2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D4W2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D4W2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D4W2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D4W2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D4W2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D4W2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D4W2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D4W2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D4W2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D4W2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms