Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tomm20lQ9D4V6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tomm20lQ9D4V6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tomm20lQ9D4V6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tomm20lQ9D4V6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tomm20lQ9D4V6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm20lQ9D4V6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm20lQ9D4V6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm20lQ9D4V6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm20lQ9D4V6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm20lQ9D4V6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm20lQ9D4V6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm20lQ9D4V6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tomm20lQ9D4V6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tomm20lQ9D4V6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tomm20lQ9D4V6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tomm20lQ9D4V6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tomm20lQ9D4V6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tomm20lQ9D4V6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tomm20lQ9D4V6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tomm20lQ9D4V6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms