Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam90a1bQ9D4F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam90a1bQ9D4F3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam90a1bQ9D4F3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam90a1bQ9D4F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam90a1bQ9D4F3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam90a1bQ9D4F3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam90a1bQ9D4F3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam90a1bQ9D4F3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam90a1bQ9D4F3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam90a1bQ9D4F3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam90a1bQ9D4F3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam90a1bQ9D4F3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam90a1bQ9D4F3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam90a1bQ9D4F3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam90a1bQ9D4F3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms