Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
4933402E13RikQ9D4D2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4933402E13RikQ9D4D2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
4933402E13RikQ9D4D2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
4933402E13RikQ9D4D2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
4933402E13RikQ9D4D2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4933402E13RikQ9D4D2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4933402E13RikQ9D4D2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4933402E13RikQ9D4D2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
4933402E13RikQ9D4D2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30■■■□□ 2.39
4933402E13RikQ9D4D2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
4933402E13RikQ9D4D2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
4933402E13RikQ9D4D2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4933402E13RikQ9D4D2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
4933402E13RikQ9D4D2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4933402E13RikQ9D4D2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4933402E13RikQ9D4D2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4933402E13RikQ9D4D2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4933402E13RikQ9D4D2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4933402E13RikQ9D4D2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
4933402E13RikQ9D4D2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
4933402E13RikQ9D4D2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
4933402E13RikQ9D4D2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
4933402E13RikQ9D4D2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
4933402E13RikQ9D4D2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4933402E13RikQ9D4D2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4933402E13RikQ9D4D2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms