Protein–RNA interactions for Protein: Q9D309

Fam3b, Protein FAM3B, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3bQ9D309 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3bQ9D309 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam3bQ9D309 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3bQ9D309 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam3bQ9D309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3bQ9D309 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam3bQ9D309 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam3bQ9D309 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam3bQ9D309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam3bQ9D309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam3bQ9D309 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms