Protein–RNA interactions for Protein: Q9D306

Mgat4c, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4cQ9D306 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat4cQ9D306 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat4cQ9D306 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat4cQ9D306 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat4cQ9D306 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mgat4cQ9D306 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mgat4cQ9D306 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mgat4cQ9D306 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mgat4cQ9D306 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4cQ9D306 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4cQ9D306 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4cQ9D306 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mgat4cQ9D306 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat4cQ9D306 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat4cQ9D306 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms