Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl53Q9D1H8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl53Q9D1H8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl53Q9D1H8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl53Q9D1H8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl53Q9D1H8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl53Q9D1H8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl53Q9D1H8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl53Q9D1H8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl53Q9D1H8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms