Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab1bQ9D1G1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab1bQ9D1G1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab1bQ9D1G1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab1bQ9D1G1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab1bQ9D1G1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab1bQ9D1G1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab1bQ9D1G1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab1bQ9D1G1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab1bQ9D1G1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab1bQ9D1G1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab1bQ9D1G1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab1bQ9D1G1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab1bQ9D1G1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab1bQ9D1G1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab1bQ9D1G1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab1bQ9D1G1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab1bQ9D1G1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab1bQ9D1G1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab1bQ9D1G1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab1bQ9D1G1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab1bQ9D1G1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms