Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbdc1Q9D0B6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbdc1Q9D0B6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pbdc1Q9D0B6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbdc1Q9D0B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pbdc1Q9D0B6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pbdc1Q9D0B6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbdc1Q9D0B6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbdc1Q9D0B6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbdc1Q9D0B6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbdc1Q9D0B6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbdc1Q9D0B6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbdc1Q9D0B6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbdc1Q9D0B6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbdc1Q9D0B6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbdc1Q9D0B6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbdc1Q9D0B6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms