Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0A3

Arpin, Arpin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArpinQ9D0A3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ArpinQ9D0A3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ArpinQ9D0A3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ArpinQ9D0A3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ArpinQ9D0A3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ArpinQ9D0A3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ArpinQ9D0A3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ArpinQ9D0A3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArpinQ9D0A3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ArpinQ9D0A3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArpinQ9D0A3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArpinQ9D0A3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArpinQ9D0A3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArpinQ9D0A3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArpinQ9D0A3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ArpinQ9D0A3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArpinQ9D0A3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArpinQ9D0A3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ArpinQ9D0A3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArpinQ9D0A3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArpinQ9D0A3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArpinQ9D0A3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArpinQ9D0A3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArpinQ9D0A3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArpinQ9D0A3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArpinQ9D0A3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArpinQ9D0A3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArpinQ9D0A3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArpinQ9D0A3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArpinQ9D0A3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArpinQ9D0A3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms