Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spc24Q9D083 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spc24Q9D083 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spc24Q9D083 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spc24Q9D083 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spc24Q9D083 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spc24Q9D083 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spc24Q9D083 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spc24Q9D083 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spc24Q9D083 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spc24Q9D083 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spc24Q9D083 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spc24Q9D083 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spc24Q9D083 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spc24Q9D083 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spc24Q9D083 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spc24Q9D083 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spc24Q9D083 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spc24Q9D083 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spc24Q9D083 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spc24Q9D083 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spc24Q9D083 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spc24Q9D083 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spc24Q9D083 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms