Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmss1Q9CZT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmss1Q9CZT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmss1Q9CZT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmss1Q9CZT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmss1Q9CZT6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmss1Q9CZT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmss1Q9CZT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmss1Q9CZT6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmss1Q9CZT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmss1Q9CZT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmss1Q9CZT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmss1Q9CZT6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmss1Q9CZT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmss1Q9CZT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmss1Q9CZT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmss1Q9CZT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms