Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cmtm6Q9CZ69 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmtm6Q9CZ69 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cmtm6Q9CZ69 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cmtm6Q9CZ69 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cmtm6Q9CZ69 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmtm6Q9CZ69 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtm6Q9CZ69 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cmtm6Q9CZ69 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm6Q9CZ69 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtm6Q9CZ69 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtm6Q9CZ69 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cmtm6Q9CZ69 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm6Q9CZ69 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm6Q9CZ69 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms