Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rex1bdQ9CYZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rex1bdQ9CYZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rex1bdQ9CYZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rex1bdQ9CYZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rex1bdQ9CYZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rex1bdQ9CYZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rex1bdQ9CYZ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rex1bdQ9CYZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rex1bdQ9CYZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rex1bdQ9CYZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rex1bdQ9CYZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rex1bdQ9CYZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rex1bdQ9CYZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rex1bdQ9CYZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rex1bdQ9CYZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rex1bdQ9CYZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rex1bdQ9CYZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rex1bdQ9CYZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rex1bdQ9CYZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rex1bdQ9CYZ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rex1bdQ9CYZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rex1bdQ9CYZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rex1bdQ9CYZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rex1bdQ9CYZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rex1bdQ9CYZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rex1bdQ9CYZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rex1bdQ9CYZ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rex1bdQ9CYZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rex1bdQ9CYZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rex1bdQ9CYZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms