Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hdhd3Q9CYW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hdhd3Q9CYW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hdhd3Q9CYW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hdhd3Q9CYW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdhd3Q9CYW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdhd3Q9CYW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdhd3Q9CYW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdhd3Q9CYW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms