Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9CYI0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q9CYI0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9CYI0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9CYI0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9CYI0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9CYI0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9CYI0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9CYI0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9CYI0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Q9CYI0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Q9CYI0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q9CYI0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9CYI0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9CYI0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9CYI0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9CYI0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9CYI0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9CYI0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Q9CYI0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9CYI0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Q9CYI0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q9CYI0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Q9CYI0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q9CYI0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q9CYI0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q9CYI0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9CYI0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9CYI0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9CYI0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9CYI0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9CYI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9CYI0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9CYI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9CYI0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9CYI0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q9CYI0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q9CYI0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms