Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bud23Q9CY21 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bud23Q9CY21 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bud23Q9CY21 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Bud23Q9CY21 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bud23Q9CY21 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bud23Q9CY21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bud23Q9CY21 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bud23Q9CY21 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bud23Q9CY21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bud23Q9CY21 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bud23Q9CY21 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bud23Q9CY21 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bud23Q9CY21 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bud23Q9CY21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bud23Q9CY21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bud23Q9CY21 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bud23Q9CY21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bud23Q9CY21 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bud23Q9CY21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bud23Q9CY21 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bud23Q9CY21 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bud23Q9CY21 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bud23Q9CY21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bud23Q9CY21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bud23Q9CY21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bud23Q9CY21 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bud23Q9CY21 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bud23Q9CY21 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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