Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp23Q9CX11 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Utp23Q9CX11 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp23Q9CX11 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp23Q9CX11 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp23Q9CX11 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Utp23Q9CX11 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Utp23Q9CX11 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp23Q9CX11 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp23Q9CX11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp23Q9CX11 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp23Q9CX11 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Utp23Q9CX11 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp23Q9CX11 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp23Q9CX11 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp23Q9CX11 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp23Q9CX11 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp23Q9CX11 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp23Q9CX11 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Utp23Q9CX11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp23Q9CX11 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp23Q9CX11 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp23Q9CX11 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp23Q9CX11 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp23Q9CX11 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms