Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn1Q9CWM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn1Q9CWM4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn1Q9CWM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn1Q9CWM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn1Q9CWM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn1Q9CWM4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfdn1Q9CWM4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfdn1Q9CWM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn1Q9CWM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pfdn1Q9CWM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn1Q9CWM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn1Q9CWM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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