Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspo2Q9CRZ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspo2Q9CRZ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspo2Q9CRZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspo2Q9CRZ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tspo2Q9CRZ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspo2Q9CRZ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspo2Q9CRZ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspo2Q9CRZ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspo2Q9CRZ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspo2Q9CRZ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms