Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CRC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CRC3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9CRC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9CRC3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9CRC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9CRC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9CRC3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9CRC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CRC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CRC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CRC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CRC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CRC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CRC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CRC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CRC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CRC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CRC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CRC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CRC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CRC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CRC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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