Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc96Q9CR92 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc96Q9CR92 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc96Q9CR92 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc96Q9CR92 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc96Q9CR92 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc96Q9CR92 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc96Q9CR92 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc96Q9CR92 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc96Q9CR92 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc96Q9CR92 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc96Q9CR92 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc96Q9CR92 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc96Q9CR92 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc96Q9CR92 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc96Q9CR92 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc96Q9CR92 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc96Q9CR92 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc96Q9CR92 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc96Q9CR92 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc96Q9CR92 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc96Q9CR92 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc96Q9CR92 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc96Q9CR92 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc96Q9CR92 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc96Q9CR92 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc96Q9CR92 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc96Q9CR92 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc96Q9CR92 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc96Q9CR92 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc96Q9CR92 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc96Q9CR92 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc96Q9CR92 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc96Q9CR92 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc96Q9CR92 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc96Q9CR92 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc96Q9CR92 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms