Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ykt6Q9CQW1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ykt6Q9CQW1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ykt6Q9CQW1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ykt6Q9CQW1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ykt6Q9CQW1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ykt6Q9CQW1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ykt6Q9CQW1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ykt6Q9CQW1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ykt6Q9CQW1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ykt6Q9CQW1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ykt6Q9CQW1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ykt6Q9CQW1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ykt6Q9CQW1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ykt6Q9CQW1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ykt6Q9CQW1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ykt6Q9CQW1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ykt6Q9CQW1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ykt6Q9CQW1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ykt6Q9CQW1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ykt6Q9CQW1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ykt6Q9CQW1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ykt6Q9CQW1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ykt6Q9CQW1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms