Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT9

Uncharacterized protein C20orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQT9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQT9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQT9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQT9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQT9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9CQT9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CQT9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9CQT9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9CQT9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9CQT9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQT9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQT9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQT9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQT9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CQT9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQT9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQT9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQT9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQT9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CQT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms