Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp5f1Q9CQQ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp5f1Q9CQQ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp5f1Q9CQQ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp5f1Q9CQQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5f1Q9CQQ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5f1Q9CQQ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5f1Q9CQQ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5f1Q9CQQ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp5f1Q9CQQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms