Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc2Q9CQP2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc2Q9CQP2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc2Q9CQP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc2Q9CQP2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc2Q9CQP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc2Q9CQP2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc2Q9CQP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc2Q9CQP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc2Q9CQP2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc2Q9CQP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc2Q9CQP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc2Q9CQP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc2Q9CQP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc2Q9CQP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc2Q9CQP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms