Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN3

Tomm6, Mitochondrial import receptor subunit TOM6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm6Q9CQN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm6Q9CQN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm6Q9CQN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tomm6Q9CQN3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tomm6Q9CQN3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tomm6Q9CQN3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tomm6Q9CQN3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tomm6Q9CQN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tomm6Q9CQN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm6Q9CQN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tomm6Q9CQN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm6Q9CQN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tomm6Q9CQN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm6Q9CQN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms