Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI3

Gmfb, Glia maturation factor beta, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmfbQ9CQI3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmfbQ9CQI3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GmfbQ9CQI3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GmfbQ9CQI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GmfbQ9CQI3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GmfbQ9CQI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GmfbQ9CQI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GmfbQ9CQI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GmfbQ9CQI3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GmfbQ9CQI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GmfbQ9CQI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GmfbQ9CQI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms