Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ergic3Q9CQE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ergic3Q9CQE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ergic3Q9CQE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ergic3Q9CQE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ergic3Q9CQE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ergic3Q9CQE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ergic3Q9CQE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ergic3Q9CQE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ergic3Q9CQE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ergic3Q9CQE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ergic3Q9CQE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ergic3Q9CQE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ergic3Q9CQE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ergic3Q9CQE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ergic3Q9CQE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ergic3Q9CQE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ergic3Q9CQE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms