Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NepnQ9CQ76 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NepnQ9CQ76 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NepnQ9CQ76 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NepnQ9CQ76 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NepnQ9CQ76 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NepnQ9CQ76 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NepnQ9CQ76 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NepnQ9CQ76 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NepnQ9CQ76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NepnQ9CQ76 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NepnQ9CQ76 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NepnQ9CQ76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NepnQ9CQ76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NepnQ9CQ76 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NepnQ9CQ76 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NepnQ9CQ76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NepnQ9CQ76 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NepnQ9CQ76 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NepnQ9CQ76 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms