Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW3

Mrpl54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl54Q9CPW3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl54Q9CPW3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl54Q9CPW3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl54Q9CPW3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl54Q9CPW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl54Q9CPW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl54Q9CPW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl54Q9CPW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl54Q9CPW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl54Q9CPW3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl54Q9CPW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl54Q9CPW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl54Q9CPW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl54Q9CPW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl54Q9CPW3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl54Q9CPW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl54Q9CPW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl54Q9CPW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl54Q9CPW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl54Q9CPW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl54Q9CPW3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl54Q9CPW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl54Q9CPW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl54Q9CPW3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl54Q9CPW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl54Q9CPW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms