Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ska1Q9CPV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ska1Q9CPV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ska1Q9CPV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ska1Q9CPV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ska1Q9CPV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ska1Q9CPV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ska1Q9CPV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ska1Q9CPV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ska1Q9CPV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ska1Q9CPV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ska1Q9CPV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ska1Q9CPV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ska1Q9CPV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska1Q9CPV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ska1Q9CPV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska1Q9CPV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ska1Q9CPV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska1Q9CPV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms