Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim12aQ99PQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim12aQ99PQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim12aQ99PQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim12aQ99PQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim12aQ99PQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim12aQ99PQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim12aQ99PQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim12aQ99PQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim12aQ99PQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim12aQ99PQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim12aQ99PQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim12aQ99PQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim12aQ99PQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim12aQ99PQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim12aQ99PQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim12aQ99PQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim12aQ99PQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim12aQ99PQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim12aQ99PQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim12aQ99PQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim12aQ99PQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim12aQ99PQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim12aQ99PQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim12aQ99PQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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