Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn6Q99PL6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ubxn6Q99PL6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn6Q99PL6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn6Q99PL6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn6Q99PL6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn6Q99PL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn6Q99PL6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn6Q99PL6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn6Q99PL6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn6Q99PL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ubxn6Q99PL6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn6Q99PL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn6Q99PL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn6Q99PL6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn6Q99PL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubxn6Q99PL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ubxn6Q99PL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn6Q99PL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn6Q99PL6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn6Q99PL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn6Q99PL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn6Q99PL6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubxn6Q99PL6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn6Q99PL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms