Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tsnaxip1Q99P25 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsnaxip1Q99P25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsnaxip1Q99P25 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tsnaxip1Q99P25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tsnaxip1Q99P25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsnaxip1Q99P25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tsnaxip1Q99P25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Tsnaxip1Q99P25 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsnaxip1Q99P25 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsnaxip1Q99P25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsnaxip1Q99P25 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsnaxip1Q99P25 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsnaxip1Q99P25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsnaxip1Q99P25 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsnaxip1Q99P25 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tsnaxip1Q99P25 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms