Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GsdmcQ99NB5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GsdmcQ99NB5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GsdmcQ99NB5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GsdmcQ99NB5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GsdmcQ99NB5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GsdmcQ99NB5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GsdmcQ99NB5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GsdmcQ99NB5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GsdmcQ99NB5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GsdmcQ99NB5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GsdmcQ99NB5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GsdmcQ99NB5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GsdmcQ99NB5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms