Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtpbp4Q99ME9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtpbp4Q99ME9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtpbp4Q99ME9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtpbp4Q99ME9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtpbp4Q99ME9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtpbp4Q99ME9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtpbp4Q99ME9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtpbp4Q99ME9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtpbp4Q99ME9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtpbp4Q99ME9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtpbp4Q99ME9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtpbp4Q99ME9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtpbp4Q99ME9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtpbp4Q99ME9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtpbp4Q99ME9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp4Q99ME9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtpbp4Q99ME9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtpbp4Q99ME9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtpbp4Q99ME9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtpbp4Q99ME9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtpbp4Q99ME9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp4Q99ME9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gtpbp4Q99ME9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtpbp4Q99ME9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtpbp4Q99ME9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp4Q99ME9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtpbp4Q99ME9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtpbp4Q99ME9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtpbp4Q99ME9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtpbp4Q99ME9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtpbp4Q99ME9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtpbp4Q99ME9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms