Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm2d1Q99MB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm2d1Q99MB3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tm2d1Q99MB3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tm2d1Q99MB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm2d1Q99MB3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm2d1Q99MB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm2d1Q99MB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tm2d1Q99MB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tm2d1Q99MB3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tm2d1Q99MB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tm2d1Q99MB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tm2d1Q99MB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tm2d1Q99MB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms