Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms