Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsl24d1Q99L28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsl24d1Q99L28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsl24d1Q99L28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsl24d1Q99L28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsl24d1Q99L28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsl24d1Q99L28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsl24d1Q99L28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsl24d1Q99L28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsl24d1Q99L28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsl24d1Q99L28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsl24d1Q99L28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsl24d1Q99L28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsl24d1Q99L28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsl24d1Q99L28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsl24d1Q99L28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsl24d1Q99L28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsl24d1Q99L28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsl24d1Q99L28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsl24d1Q99L28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsl24d1Q99L28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsl24d1Q99L28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsl24d1Q99L28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms