Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf11Q99JX1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf11Q99JX1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf11Q99JX1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf11Q99JX1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf11Q99JX1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf11Q99JX1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf11Q99JX1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf11Q99JX1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf11Q99JX1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf11Q99JX1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf11Q99JX1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf11Q99JX1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Taf11Q99JX1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf11Q99JX1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf11Q99JX1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf11Q99JX1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf11Q99JX1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf11Q99JX1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf11Q99JX1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf11Q99JX1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf11Q99JX1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf11Q99JX1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Taf11Q99JX1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf11Q99JX1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf11Q99JX1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf11Q99JX1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Taf11Q99JX1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms