Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxp3Q99JB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxp3Q99JB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxp3Q99JB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Foxp3Q99JB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxp3Q99JB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Foxp3Q99JB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Foxp3Q99JB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxp3Q99JB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxp3Q99JB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxp3Q99JB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Foxp3Q99JB6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxp3Q99JB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxp3Q99JB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxp3Q99JB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxp3Q99JB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxp3Q99JB6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Foxp3Q99JB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Foxp3Q99JB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms